Δομή
Το Ευρωπαϊκό Κέντρο Βυζαντινών και Μεταβυζαντινών Μνημείων διοικείται από επταμελές Διοικητικό Συμβούλιο με τριετή θητεία που διορίζεται από τον Υπουργό Πολιτισμού. Ο αριθμός των μελών μπορεί να αυξάνεται με απόφαση του Υπουργού Πολιτισμού, και να ορίζονται έως πέντε μέλη, ως εκπρόσωποι της Ευρωπαϊκής Ένωσης, του Συμβουλίου της Ευρώπης ή άλλων διεθνών οργανισμών, εφόσον οι διεθνείς αυτοί θεσμοί και οργανισμοί μετέχουν στη χρηματοδότηση των προγραμμάτων του ΕΚΒΜΜ.
Στόχοι
Στους σκοπούς του ΕΚΒΜΜ περιλαμβάνονται ιδίως:
Η συμμετοχή σε εθνικά ή διεθνή προγράμματα επιστημονικής έρευνας και τεχνολογικής ανάπτυξης.
Η συμμετοχή σε επιστημονικές δραστηριότητες και αποστολές διεθνών οργανισμών
Η εκπόνηση και δημοσίευση επιστημονικών μελετών καθώς και κάθε άλλη πρόσφορη επιστημονική διαδικασία.
Η διοργάνωση σεμιναρίων και κύκλων μαθημάτων.
Η χορήγηση υποτροφιών για την εκπόνηση επιστημονικών μελετών ή τη συμμετοχή σε προγράμματα και δραστηριότητες του ΕΚΒΜΜ.
Η δράση του ΕΚΒΜΜ είναι συνυφασμένη και με την διαπολιτισμική συνεργασία και επικοινωνία. Το Κέντρο συνεργάζεται με την UNESCO, το Συμβούλιο της Ευρώπης και άλλους ευρωπαϊκούς και διεθνείς οργανισμούς και θεσμούς. Στη διάρκεια της πορείας του έχει αναπτύξει δράσεις και προγράμματα συνεργασίας, στις χώρες της Βαλκανικής, της Μέσης Ανατολής, του Καυκάσου, της Ν. Ευρώπης και της Β. Αφρικής. Οι δράσεις αυτές στηρίχθηκαν στην προσέγγιση των εταίρων με όρους ισοτιμίας και σεβασμού της ταυτότητάς τους, στην αξιοποίηση του τοπικού ανθρώπινου δυναμικού στα έργα που εκτελέστηκαν σε κάθε χώρα και στην καλλιέργεια πνεύματος συναντίληψης και κλίματος εμπιστοσύνης.